“Spuler, Bertold”, TDV İslam Ansiklopedisi, 37 (İstanbul 2009), s. 422-423.

“Makedonya” TDV İslam Ansiklopedisi, 27 (Ankara 2003), s. 437-444.

“İttihadcılar ve Makedonya İhtilal Komiteleri: İttihad ve Terakki Hükümetinin Başlamasına Kadar İlişkiler, Pazarlıklar ve Sonuçları”, İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Tarih Dergisi, 38 (2002-2003), s. 101-117.

“The Young Turk Revolution and the Negotiations for the Solution of the Macedonian Question”, Turcica, 36 (Paris 2004), s. 165-190.

“Bağımsızlıktan Günümüze Bulgaristan’da Yer İsimlerinin Değiştirilmesi” Balkanlarda İslam Medeniyeti II. Milletlerarası Sempozyumu Tebliğleri, Tiran, Arnavutluk, 4-7 Aralık 2003, ed. Ali Çaksu, Istanbul: IRCICA, 2006, s. 177-189.

“Osmanische Quellen zur Balkangeschichte. Eine Übersicht über die Bestände des Zentralarchivs in Istanbul und weiterer osmanischer Archive”, Südosteuropa von der vormodernen Vielfalt und nationalstaatlicher Vereinheitlichung. Festschrift für Edgar Hösch, ed. Konrad Clewing, Oliver Jens Schmitt, München: R. Oldenbourg Verlag, 2005, s. 35-85.
http://books.google.de/books?id=4eXlZq6aBrkC&pg=PA35&dq=%22Mehmet+Hacisalihoglu%22&hl=tr

“The Ottoman Administration of Bulgaria and Macedonia during the 19th – 20th Centuries in Recent Turkish Historiography: Contributions, Deficiencies and Perspectives”, Turkish Review of Balkan Studies, 11, Annual 2006, s. 85-123.

“Istanbul in Geschichte und Vorstellungswelt der orthodoxen Völker Ost- und Südosteuropas“, Istanbul: vom imperialen Herrschersitz zur Megapolis. Historiographische Betrachtungen zu Gesellschaft, Institutionen und Räumen, ed. Yavuz Köse, München: Martin Meidenbauer, 2006, s. 39-68.

“1878-1918 Arasında Romanya: İç ve Dış Siyaset ve Azınlıklar”, Tarih Bilinci, 17-18, Mart 2012, Özel Sayı: Devlet-i Aliyye-i Osmaniye’den Ayrılışının 100. Yılında Dünü ve Bugünü ile Balkanlar, s. 140-144.

“Krallık Döneminde Romanya”, Balkanlar Elkitabı, cilt II, Çorum, Ankara: Karam & Vadi, 2007, s. 541-549.

“Sosyalist Dönemde Romanya”, Balkanlar Elkitabı, cilt II, Çorum, Ankara: Karam & Vadi, 2007, s. 551-564.

“Die Zeit der Osmanenherrschaft”, Wegweiser zur Geschichte Kosovo, ed. Bernhard Chiari, 1. Baskı 2006, 3. Baskı, Agilolf Keßelring, Paderborn, München, Wien, Zürich: Ferdinand Schöningh, 2008, s. 35-41. http://www.mgfa.de/html/einsatzunterstuetzung/downloads/wwkosovoiiihacisalihogluosmanenzeit.pdf

“Die Osmanenzeit im Nahen Osten”, Wegweiser zur Geschichte Naher Osten, ed. Bernhard Chiari, Dieter H. Kollmer, Paderborn, München, Wien, Zürich: Ferdinand Schöningh, 2007, s. 35-45. http://www.mgfa.de/html/einsatzunterstuetzung/downloads/meunoii103hacisalihoglu.pdf

“Sırbistan”, TDV İslam Ansiklopedisi, 37 (İstanbul 2009), s. 120-126.

“Turkish Historiography on the Balkans during the Late Ottoman Period (1878-1914)”, Balkanistica, 22 (2009), s. 181-201.

“Osmanlı İmparatorluğundan Zorunlu Askerlik Sistemine Geçiş: Ordu Millet Düşüncesi”, Toplumsal Tarih 164 (August 2007), s. 58-64.

“Inclusion and Exclusion: Conscription in the Ottoman Empire”, Journal of Modern European History, V/2007/2, s. 264-286.

“Minorities in the Balkans and the Issue of Toponomy: the Bulgarian Case” Proceedings of the International Conference on Minority Issues in the Balkans and the EU, Istanbul: OBIV, 2007, s. 61-78. http://www.sbu.yildiz.edu.tr/

“General Introduction to Minority Issues in the Balkans”, Proceedings of the International Conference on Minority Issues in the Balkans and the EU, Istanbul: OBIV, 2007, s. 3-15.

“Ulus-devlet Politikaları ve Toponomik Değişim: Güneydoğu Bulgarisan’da Harabe Köyler”, Toplumsal Tarih, 175 (Temmuz 2008), s. 86-92.

“Borders, Maps, and Censuses. The Politicization of Geography and Statistics in the Multi-ethnic Ottoman Empire”, Comparing Empires. Encounters and Transfers in the Long Nineteenth Century , Eds. Jörn Leonhard and Ulrike von Hirschhausen, Göttingen: Vandenhoeck & Rupprecht, 2011, pp. 171-210.

“Das Bild vom Janitscharen: Die Streitkräfte des Osmanischen Reiches zwischen Tradition und Modernisierung”, Am Rande Europas? Der Balkan – Raum und Bevölkerung als Wirkungsfelder militärischer Gewalt, Im Auftrag des Militärgeschichtlichen Forschungsamtes hrsg. von Bernhard Chiari und Gerhard P. Groß unter Mitarbeit von Magnus Pahl. München: Oldenbourg, 2009, s. 233-240.

“II. Meşrutiyetin Balkan Ülkelerinde Algılanması ve Jön Türk İmajı”, 100. Yılında II. Meşrutiyet; Gelenek ve Değişim Ekseninde Türk Modernleşmesi Uluslararası Sempozyumu Bildiriler, Yay. Zekeriya Kurşun ve diğ., İstanbul: Marmara Üniversitesi Yayınları, 2009, s. 549-556.

“Jön Türklerin Balkan Politikası (1908-1913)”, Divan Disiplinler Arası Çalışmalar Dergisi, 13/2008/24, s. 99-127.

“İttihad ve Terakki Cemiyeti’nin Politikaları Bağlamında Türkçülük, Osmanlıcılık ve Türkleştirme Tartışmaları”, Dosya: 19.yy.’dan 20. yy.’a Osmanlı’da Vatandaşlık Kavramının Gelişimi, Toplumsal Tarih, 182 (Şubat 2009), s. 64-69.

“Bulgaristan’da Savaş ve Göçün Yerleşim Yerleri Üzerine Etkileri”, Balkanlarda İslam Medeniyeti Uluslararası Üçüncü Sempozyum Tebliğleri, Bükreş, 1-5 Kasım 2006,cilt II, İstanbul 2011, s. 421-467.

“İçerme ve Dışlama: Osmanlı İmparatorluğu’nda Askere Alma”, Türkçe çeviri Yetkin Başkavak, Türkiye’de Ordu, Devlet ve Güvenlik Siyaseti, Der. E. B. Paker, İ. Akça, İstanbul: İstanbul Bilgi Üniversitesi Yayınları, 2010, s. 79-103.

“Tuzcuoğulları” TDV İslam Ansiklopedisi, 41, İstanbul 2012, s. 451-453.

“Yunanistan” TDV İslam Ansiklopedisi, 43, İstanbul 2013, s. 586-595.

“Bulgaristan’dan Göç ve Terkedilmiş Köyler”, Avrasya Konferansları. Bildiriler I, Yay. Hakan Güneş, M. Sait Türkhan, İstanbul: İ. Ü. Avrasya Enstitüsü, 2010, s. 57-89.

„Flucht, Vertreibung und Emigration: Osmanische Entsiedlung in Bulgarien“, Osmanen und Islam in Südosteuropa. Abhandlungen der Akademie der Wissenschaften zu Göttingen, Ed. R. Lauer, H. G. Majer, Berlin-New York: de Gruyter, 2013, s. 433-458.

„Thrakien. Eine wiederentdeckte Region auf dem Balkan”, Das Südosteuropa der Regionen, Eds. Oliver Jens Schmitt, Michael Metzeltin, Wien: Österreiche Akademie der Wissenschaften, 2015, s. 581-602.

“’89 Göçü’ ile İlgili Tarih Yazımı ve Kamuoyu Algıları”, 89 Göçü. Bulgaristan’da 1984-89 Azınlık Politikaları ve Türkiye’ye Zorunlu Göç, Eds. Neriman Ersoy-Hacısalihoğlu, Mehmet Hacısalihoğlu, Yıldız Teknik Üniversitesi Balkan ve Karadeniz Araştırmaları Merkezi (BALKAR) & Balkanlar Medeniyet Merkezi (BALMED), İstanbul 2012, s. 31-74.

“Bitola”, Encyclopaedia of Islam, 3rd ed., Leiden, Boston: Brill, 2014, pp. 54-57.

“Muslim and Orthodox Resistance Against the Berlin Peace Treaty in the Balkans”, War and Diplomacy: The Russo-Turkish War of 1877-1878 and the Treaty of Berlin, Ed. Hakan Yavuz, Peter Sluglett, Salt Lake City 2011, s. 125-143.

“The Young Turk Policy of Macedonia: Cause of the Balkan Wars?”, War and Nationalism. The Balkan Wars, 1912-1913, and their Sociopolitical Implications, Eds. M. Hakan Yavuz, Isa Blumi, Salt Lake City: The University of Utah Press, 2013, s. 100-131.

“Balkanlar’da Yer İsimlerini Değiştirme Siyaseti: Avusturya, Yunanistan, Bulgaristan ve Türkiye Örnekleri”, Türk Tarihinde Balkanlar / Balkans in the Turkish History, Eds. Zeynep İskefiyeli / M. Bilal Çelik / Serkan Yazıcı, Sakarya: Sakarya Üniversitesi Balkan Araştırmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi yayınları, 2013, s. 1327-1354.

“[Balkanlar’da] Ulus Devletlerin Kurulma Sürecini Etkileyen Faktörler”, “Ulus Devletlerin Kuruluşu”, Balkanlarda Siyaset, Ed. Şaban H. Çalış, Birgül Demirtaş, Eskişehir: Anadolu Üniversitesi, 2012, s. 75-84;

“Yane Sandanski as a political leader in the era of the Young Turks”, Cahiers balkaniques, 40 (2012), s. 61-85; http://ceb.revues.org/pdf/1192

“Doğu ve Güneydoğu Avrupa’daki Ortodoks Halkların Tarihinde ve Düşünce Dünyasında İstanbul”, İstanbul. İmparatorluk Başkentinden Megakente, Ed. Yavuz Köse, Çev. Ayşe Dağlı, İstanbul: Kitapyayınevi, 2011, s. 60-90.

Trabzon’da Ayanlık Mücadelesi: Hacısalihzade Hasan Ağa, Ömer Ağa ve Büyük Ali Ağa (1737-1844) [Fight for Lordship in Trabzon: Hacısalihzade Hasan Ağa, Ömer Ağa and Ali Ağa the Great], Trabzon: Serander Yayınları, 2013, 350 s., 978-9944-374-56-9. (Gözden geçirilmiş 2. Baskı, Haziran 2014, 356 s.).

Doğu Rumeli’de Kayıp Köyler: İslimye Sancağı’nda Göçler, İsim Değişikleri ve Harabeler [Lost Villages in Eastern Rumelia: Emigration, Place Name Changes and Lost Villages in the District of İslimye/Sliven (Southeastern Bulgaria)], İstanbul: Bağlam Yayınları, 2008, 264 s., ISBN: 978-975-8803-95-8.

Jöntürkler ve Makedonya Sorunu 1890-1918 [The Young Turks and the Macedonian Question 1890-1918], Tükçeye çev. İhsan Catay, İstanbul: Tarih Vakfı Yurt Yayınları, 2008, xv+498 s., ISBN: 978-975-333-216-3

Die Jungtürken und die Mazedonische Frage (1890-1918) [The Young Turks and the Macedonian Question 1890-1918], Munich: R. Oldenbourg Verlag, 2003, 445 s., (Südosteuropäische Arbeiten 116), ISBN: 3-486-56745-4

1864 Kafkas Tehciri: Kafkasya’da Rus Kolonizasyonu, Savaş ve Sürgün [Caucasian Exodus of 1864: Russian Colonization of Caucasia, War and Exodus], İstanbul: Yıldız Teknik Üniversitesi Balkan ve Karadeniz Araştırmaları Merkezi (BALKAR) & İslam Tarih, Sanat ve Kültür Araştırma Merkezi (IRCICA), 2014, 727 s., ISBN 978-975-461-508-1

89 Göçü. Bulgaristan’da 1984-89 Azınlık Politikaları ve Türkiye’ye Zorunlu Göç [Forced Migration of 1989: Minority Policies in Bulgaria between 1984 and 1989 and the Forced Migration to Turkey], Eds. Neriman Ersoy-Hacısalihoğlu, Mehmet Hacısalihoğlu, Istanbul: Yıldız Teknik Üniversitesi Balkan ve Karadeniz Araştırmaları Merkezi (BALKAR) & Balkanlar Medeniyet Merkezi (BALMED), 2012, 678 s., ISBN 978-975-461-484-8.

Dosya: 19.yy.’dan 20. yy.’a Osmanlı’da Vatandaşlık Kavramının Gelişimi [The Development of the Concept of Citizenship in the Ottoman Empire from 19th to 20th Century], Toplumsal Tarih, 182 (Şubat 2009), s. 53-92.

Proceedings of the International Conference on Minority Issues in the Balkans and the EU, Istanbul: OBIV, 2007, 185 s., ISBN 978-975-7341-42-0.

Seminer Ödevi Nedir, Nasıl Yazılır? Sosyal Bilimlerde Lisans ve Lisansüstü Seminer (Dönem) Ödevi Yazma Teknikleri. İstanbul: Ofis2005, 2016.

(Hale Özkasım, Hatice Aynur ve Turhan Erkmen ile birlikte), Akademik Araştırma ve Yazım Klavuzu: Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri – Sanatta Yeterlik Eser Çalışması Yazım Kılavuzu, İstanbul: YTÜ Sosyal Bilimler Enstitüsü, 2007.

“1864 Tehcirinin Araştırmalarda ve Türkiye Kamuoyundaki Konumu”, 1864 Kafkas Tehciri: Kafkasya’da Rus Kolonizasyonu, Savaş ve Sürgün, Ed. Mehmet Hacısalihoğlu, İstanbul: Yıldız Teknik Üniversitesi Balkan ve Karadeniz Araştırmaları Merkezi (BALKAR) & İslam Tarih, Sanat ve Kültür Araştırma Merkezi (IRCICA), 2014, s. 25-44.

“Ayanlık Döneminde Tonya ve Akçaabat’ta Hacısalihoğlu Ailesi: Hasan Ağa, Ömer Ağa ve Büyük Ali Ağa (1737-1844)”, Dünden Bugüne Akçaabat Sempozyumu Bildiriler, Trabzon: Akçaabat Belediyesi, 2014, s. 43-62.

“17. Das Osmanische Reich“, Quellen zur europaeischen Verfassungsgeschichte im 19. Jahrhundert, Teil 3: 1848-1870, Eds. Peter Brandt, Werner Daum, Martin Kirsch, Arthur Schlegelmich, Bonn: Dietz, 2015 (CD-ROM) (ISBN 9783801241469).

“Makedonya Güncel Tarih Ders Kitaplarında Balkan Savaşları”, Balkan Savaşlarının 100. Yılı, 11-13 Mayıs 2012, Bildiriler, İstanbul 2012, s. 162-172.